Aan dit artikel is vele uren gewerkt. Opzoeken, vertalen, op de website plaatsen enz. Als u ons wilt ondersteunen dan kan dat via een al of niet anonieme donatie. Elk bedrag is welkom hoe klein ook. Klik hier als u ons wilt helpen kanker-actueel online te houden Wij zijn een ANBI organisatie en dus is uw donatie in principe aftrekbaar voor de belasting
8 september 2014: lees ook eens dit artikel:
8 augustus 2014: Bron: Cell online: (DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2014.06.049)
Nieuwe tumorindeling aan de hand van biomarkers is nodig en kan en zal behandelingen sterk veranderen voor veel kankerpatiënten. Nu al blijkt 10% bij 12 verschillende vormen van kanker een andere behandeling te vereisen in vergelijking met de behandelingsprotocollen op basis van de geldende richtlijnen en dit zal de komende jaren, als er meer en meer onderzoek vrijkomt oplopen tot wel 50%.
Aldus de auteurs - Joshua M. Stuart, PhD, hoogleraar biomoleculaire engineering aan de Universiteit van Santa Cruz, Californië, en Charles Perou, MD, en collega's van de Universiteit van North Carolina in Chapel Hill - van een grote moleculaire classificatie studie naar de verschillen tussen de standaard diagnose aan de hand van organen in vergelijking met diagnose aan de hand van biomarkers (eiwitexpressie en DNA mutaties) bij 12 veel voorkomende vormen van kanker.
De studie werd uitgevoerd door onderzoekers van het Cancer Genome Atlas Research Network (TCGA) en 7 augustus 2014 gepubliceerd in Cell online.
Figure 1
Integrated Cluster-Of-Cluster Assignments Analysis Reveals 11 Major Subtypes
(A) Integration of subtype classifications from 5 “omic” platforms resulted in the identification of 11 major groups/subtypes from 12 pathologically defined cancer types. The groups are identified by number and color in the second bar, with the tissue of origin specified in the top bar. The matrix of individual “omic” platform type classification/subtype schemes was clustered, and each data type is represented by a different color: copy number, black; DNA methylation, purple; miRNA, blue; mRNA, red; and RPPA, green.
"Met behulp van biomarkeronderzoek naast de standaard diagnose technieken werd een behandeling bij 1 op de 10 patiënten aangepast." aldus Stuart en Perou. "In feite is die 10% herindeling een onderschatting
omdat niet alle tumoren van alle weefsels zijn vertegenwoordigd in deze studie en sommige weefsels waren ondervertegenwoordigd." "Het is mogelijk dat tot 50% van de tumoren zal worden geherkwalificeerd als meer en meer tumorweefsel zou worden geanalyseerd via de biomarkers methode", aldus dr. Dr Stuart.
Deze studie bevestigt wat wij al een hele tijd proberen duidelijk te maken dat voor veel kankerpatiënten een receptorenonderzoek en DNA mutatie onderzoek cruciaal kan zijn voor een optimale behandeling. Zie ook hoe wij u daarbij kunnen en willen helpen.
Opzet en resultaten studie:
Het idee een indeling van de tumoren te maken op basis van moleculaire eigenschappen kwam uit het TCGA Pan-cancer Analyses project. "In het TCGA project dat wordt uitgevoerd bij verschillende tumor types, werden we getroffen door zowel de overeenkomsten als de verschillen die we zagen," aldus Dr Stuart.. "Dit leidde tot het idee van het doen van een uitgebreide analyse van moleculaire gegevens verdeeld over verschillende soorten tumoren."
De onderzoekers analyseerden de moleculaire gegevens van meer dan 3500 tumoren in de eerste Pan-Cancer 12 set - de profielen van de eerste 12 tumor types - uitgevoerd door het TCGA consortium.
De gegevens werden gegenereerd in 6 verschillende "platforms", waaronder genomische platforms voor DNA en RNA sequentie en een platform voor eiwitexpressie. De gegevens werden geanalyseerd op elk platform afzonderlijk en vervolgens door een combinatie van de 6 platforms.
"De definitie van de gegevens gebruikt bij de herindeling waren gebaseerd op een analyse van de moleculaire profielen in alle platforms," aldus hoofdonderzoeker Katherine A. Hoadley, PhD, van de Universiteit van North Carolina in Chapel Hill.
De moleculaire data werden gegenereerd en gedefinieerd naar overeenkomsten en verschillen, ongeacht of ze werden geanalyseerd op 1 platform of een combinatie van platforms. De onderzoekers constateerden dat voor veel tumoren, moleculaire classificaties of subtypen reflecteerden met het weefsel waaruit ze afkomstig waren. Echter, sommige tumoren verzetten zich tegen een categorisering op basis van het weefsel van herkomst," aldus Dr Stuart.
Blaaskanker bv. bleek zeer divers te zijn en zou beter moleculair kunnen worden ingedeeld als blaas-specifieke kanker, plaveiselcarcinomen (zoals gezien bij hoofd/hals tumoren en longen) of adenocarcinoom (zoals die bij bepaalde vormen van longkanker). Bovendien bleken de meeste plaveiselcel vormen van hoofd/halstumoren, vormen van longkankertumoren en sommige vormen van blaaskankertumoren samen ingedeeld te kunnen worden in 1 groep op basis van hun biomarkers - hun moleculaire gegevens.
De onderzoekers stellen dat op basis van o.a. deze studie dat de divergentie en convergentie beter zou kunnen worden verklaard door de cel van oorsprong dan door het weefsel van herkomst en dat de
classificatie van tumoren op basis van moleculaire gegevens gevolgen heeft voor de behandelingen.
Implicaties voor de behandeling:
"De meeste huidige protocollen voor behandeling van tumoren zijn gebaseerd op het weefsel van oorsprong. Misschien wanneer tumoren een grote moleculaire diversiteit tonen, zoals blaaskanker, moet de behandeling worden gebaseerd op een moleculaire analyse naast de diagnose van het weefsel van het orgaan", aldus Dr Stuart.
Basaalachtige borstkanker (plaveiselcarcinoomachtig) bleek vaak ook sterk te lijken op een originele plaveiselcelcarcinoom of op eierstokkanker. "Hoewel de basaalachtige borstkanker ontstaat in de borst, op moleculair niveau, lijkt het veel op een plaveiselcelcarcinoom van hoofd/halstumoren, aldus 1 platform, of lijkt het eerder eierstokkanker wanneer geanalyseerd via een ander platform,"
Op basis van deze waarnemingen kan basaalachtige borstkanker beter op dezelfde manier worden behandeld als eierstokkanker of vormen van plaveiselcarcinomen, aldus de onderzoekers
Follow-up studies zijn nodig om deze bevindingen te bevestigen, maar deze studie heeft de basis gelegd voor het definiëren van tumoren op basis van moleculaire gegevens. Moleculaire subtypering is in principe ervoor gereed om de patiënten betere behandelingsopties te bieden.
De moleculaire herclassificatie van tumoren zal ook helpen om andere studieprotocollen te ontwerpen. In de nabije toekomst zal het zo worden dat patiënten worden ingeschreven in klinische studies op basis van het moleculaire profiel van de tumoren, in plaats van het weefsel van organenoorsprong.
(Redactie: overigens gebeurt dit nu ook al, er zijn wereldwijd veel fase I/II studies geopend gebaseerd op biomarkerprofielen, echter meestal alleen open voor kankerpatiënten die uitbehandeld zijn en ver uitgezaaide vormen van kanker hebben. Beter zou natuurlijk zijn om direct bij de eerste diagnose de biomeolecualire profielen mee te nemen in de diagnose en behandelingsplannen). .
De huidige studie werd beperkt tot onderzoek naar weefsel van de primaire tumoren. Stadiumspecifiek en weefsel van uitzaaiingen zullen later ook meegenomen moeten worden in een definitieve classificatie.
Conclusie:
"In de toekomst zal de moleculaire profilering worden gebruikt om de tumor behandelingen verder te personaliseren." "Het zal uiteindelijk zorgen voor de biologische basis voor een gepersonaliseerde behandeling van kanker die patiënten en artsen met spanning af wachten," aldus de onderzoekers.
De auteurs hebben geen relevante financiële relaties bekendgemaakt.
Het volledige studierapport: Multiplatform Analysis of 12 Cancer Types Reveals Molecular Classification within and across Tissues of Origin is gratis in te zien.
Hier het abstract van deze studie:
Multiplatform Analysis of 12 Cancer Types Reveals Molecular Classification within and across Tissues of Origin
Source: Cell online: DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2014.06.049
, Charles M. Perou , Joshua M. Stuart20Co-first authorHighlights
- •New integrated cross-tumor-type classification carries prognostic information
- •Convergence of a multitissue squamous type
- •Divergence of bladder cancers into multiple pan-cancer subtypes
- •Rich resource for data-mining and biological discovery
Summary
Recent genomic analyses of pathologically defined tumor types identify “within-a-tissue” disease subtypes. However, the extent to which genomic signatures are shared across tissues is still unclear. We performed an integrative analysis using five genome-wide platforms and one proteomic platform on 3,527 specimens from 12 cancer types, revealing a unified classification into 11 major subtypes. Five subtypes were nearly identical to their tissue-of-origin counterparts, but several distinct cancer types were found to converge into common subtypes. Lung squamous, head and neck, and a subset of bladder cancers coalesced into one subtype typified by TP53 alterations, TP63 amplifications, and high expression of immune and proliferation pathway genes. Of note, bladder cancers split into three pan-cancer subtypes. The multiplatform classification, while correlated with tissue-of-origin, provides independent information for predicting clinical outcomes. All data sets are available for data-mining from a unified resource to support further biological discoveries and insights into novel therapeutic strategies.
Gerelateerde artikelen
- 6 nieuwe doorbraken in de strijd tegen kanker worden gepresenteerd door het World Economic Forum met bijbehorende video
- 90 procent van mensen met uitgezaaide kanker heeft meerdere DNA afwijkingen. Slechts 5 procent kreeg ook optimale behandeling daarvoor.
- Antibiotica binnen een maand vooraf aan immuuntherapie met anti-PD medicijnen geeft veel slechtere resultaten op overall overleving dan zonder antibiotica bij verschillende vormen van primaire kanker.
- Anti-PD medicijnen zoals nivolumab, Pembrolizumab en atezolizumab gegeven als immuuntherapie geven zeer goede resultaten bij verschillende vormen van kanker met solide tumoren, zelfs zonder Ligand-1 receptorstatus copy 1
- Bacterien in uitzaaiingen van kankerpatienten zijn door Nederlandse onderzoekers in beeld gebracht en in een gedetailleerde catalogus opgeslagen
- Behandelen van kanker verschuift steeds meer van chemotherapie naar biologische behandelingen, gerichte therapie waaronder immuuntherapie met gemoduleerde virussen die de minste bijwerkingen geven
- Biomarkers zoals PD-L1, CD163+ en NRAS mutaties en gegevens zoals uitzaaiingen later ontstaan bepalen kans van effectiviteit van immuuntherapie met anti PD medicijnen bij melanomen
- Bloedtest, uitgevoerd op in bloed circulerend DNA (ctDNA) op DNA mutaties afwijkingen, kan heel nauwkeurig nagenoeg alle vormen van kanker ontdekken.
- CHRISPR-CAS9 infuus blijkt genezende behandeling voor erfelijke aandoening angio-oedeem, aldus tussenresultaten van internationale studie met Nederlandse deelname.
- De biologische processen waarom en hoe kankercellen uitzaaien wordt beter begrepen, tumorcellen vroeger ontdekt en lijkt ook steeds beter te behandelen
- De huidige staat van moleculair testen in het behandelen van kankerpatienten met solide tumoren. Een uitstekend overzichtsartikel met de nieuwste ontwikkelingen over RNA, DNA en eiwitten anno 2019
- Diagnosetest PERCEPTION via AI - Kunstmatige Intelligentie ontwikkeld en met hulp van single-cell RNA-sequencing voorspelt nauwkeurig of een specifiek medicijn van de kankerpatient zal aanslaan of resistent zal zijn.
- DRUP studie geeft bij 37 procent van de patienten alsnog een therapeutisch effect met 6 procent CR en 14 procent PR en 17 procent stabiele ziekte
- EMA: Veel nieuwe kankermedicijnen in de EU hebben geen bewezen toegevoegde waarde blijkt uit Nederlandse studie naar goedgekeurde kankermedicijnen door het Europees Geneesmiddelenbureau (EMA).
- ESMO - European Society for Medical Oncology heeft een gids uitgegeven voor patienten over hoe personalised medicine werkt en stand van zaken
- FDA ondersteunt onderzoek naar personalised medicine op basis van mutaties ongeacht in welk lichaamsdeel de kanker zich het eerst openbaart.
- Genetisch onderzoek via Germline testen (kiembaan testen) werd in periode 2013 tot 2019 in Georgie en Californie bij slechts 7 procent gedaan onder 1 369 602 patienten met twee jaar kanker.
- Geneesmiddel (ARS1620) verandert kankergen (KRAS mutatie) dat kwaadaardige tumoren beschermt tegen immuunsysteem in een doelwit voor immuunsysteem en helpt immuuntherapie kankercellen te elimineren
- Gentherapie zoals Chrispr-cas en base-editors zijn zeer succesvol bij erfelijke ziekten waaronder ook vormen van kanker zoals sikkelcelziekte
- Gerichte behandelingen met Aurora kinaseremmers geven soms uitstekende resultaten bij veel vormen van kanker. Een reviewstudie
- Immuuntherapie met HER2-gerichte CT-0508 (CAR-Macrofaag therapie) geeft bij solide tumoren van verschillende vormen van kanker met HER2 positieve expressie hoopvolle resultaten
- Immuuntherapie met pembrolizumab bij patiënten met verschillende vormen van uitgezaaide kanker met hoge microsatellietinstabiliteit (MSI-H) en DNA-mismatch-reparatie-deficiënte (dMMR) geeft uitstekende en duurzame resultaten op overall overleving
- Immuuntherapie met nivolumab zorgt voor duurzame en sterk verbeterde overall overleving bij verschillende vormen van kanker, melanomen, longkanker en nierkanker copy 1
- Internationale groep van 180 wetenschappers stelt rapport op hoe en met welke niet-toxische middelen - voedingsstoffen de effectiviteit te verbeteren, recidieven te voorkomen en de bijwerkingen te verminderen van personalised medicine
- Irina Kareva gebruikt wiskundige modellen die de dynamiek van kanker beschrijven, met het doel nieuwe geneesmiddelen te ontwikkelen die gericht zijn op tumoren.
- Kanker-actueel kan en wil helpen - begeleiden bij aanvragen van een volledig biomoleculair receptorenonderzoek en genenonderzoek
- Kankermedicijnen geven in de klinische praktijk veel minder effect dan uit de studies van farmaceutische bedrijven is aangetoond. Maar zijn wel ontzettend duur.
- Kankerremmende eiwitten kunnen bij mutatie die gen uitschakelt veranderen van kankerremmend in stimulerend, ontdekten Nederlandse onderzoekers
- Larotrectinib geeft bijzonder goede resultaten (76 procent respons met 12 procent complete remissies) bij alle vormen van solide tumoren met een positieve TRK Fusion mutatie
- Larotrectinib: Met de goedkeuring van Larotrectinib op basis van 1 specifieke afwijking en niet op basis van primaire tumor zorgt de FDA voor een doorbraak in het behandelen van kanker
- Lenvatinib Plus Pembrolizumab bij patiënten met inoperabele gevorderde nierkanker, buikvlieskanker, melanomen en andere gevorderde kanker met solide tumoren geeft uitstekende resultaten met meer dan de helft remissies van 50 procent of meer copy 1
- Medicijnen voorschrijven op basis van DNA profiel van de patient voorkomt 30 procent minder bijwerkingen blijkt uit internationale studie onder leiding van LUMC Leiden
- MSC-1 een medicijn dat de groei van de kankerstamcellen afremt door LIF blokkade en immuunsysteem activeert laat spectaculair goede resultaten zien in fase I studie.
- Mytomorrows breidt aanbod aan experimentele medicijnen voor kankerpatienten uit met 11 nieuwe nog niet geregistreerde medicijnen en stelt deze beschikbaar voor uitbehandelde kankerpatienten
- Nederland betaalt veel meer voor kankermedicijnen, soms tot 50 procent of meer, dan andere landen blijkt uit vergelijkend onderzoek tussen 18 landen copy 1
- NCI-MATCH-studie toont aan dat een biomoleculaire analyse - DNA en receptorenonderzoek - belangrijk is in hoe een kankerpatient te behandelen.
- Nieuw medicijn - PD-0332991 - stopt groei hersentumoren Glioblastoom in dierproeven. Zodra gestopt werd met dit medicijn gingen de tumoren weer groeien. Fase I studie bij 33 patienten met nierkanker en lymfklierkanker bevestigt veiligheid van dit middel
- Nieuwe, dure kankermedicijnen zijn voortaan sneller beschikbaar door het Drug Access Protocol (DAP) dat is ontwikkeld door oncologen, verzekeraars en Zorginstituut Nederland
- Overzicht van alle wereldwijd geregistreerde medicijnen binnen immuuntherapie en lopende studies met immuuntherapie copy 1
- Overzicht van studies met medicijnen en behandelingen om tumoren met KRAS mutaties aan te pakken. Vooral combinatiebehandelingen zijn veelbelovend.
- PI3K/AKT/mTOR pathway speelt cruciale rol in apoptose proces, DNA herstel, metabolisme in de cel en angiogenese.
- Pembrolizumab - Keytruda geeft bij solide tumoren van verschillende oorsprong 21 procent complete remissies en 53 procent gedeeltelijke remissies.
- Personalised medicine door receptorenonderzoek geeft veel betere resultaten in fase 1 studies dan experimenteel onderzoek zonder receptorenonderzoek
- Prof. Bernards over de doorbraak bij darmkanker met Kras mutatie en bij melanomen met BRAF mutatie in DWDD van donderdag 27 maart 2014
- POLE mutatie: veel kankerpatienten met erfelijke vormen van kanker hebben naast een P1-ligand een POLE mutatie en reageren goed op immuuntherapie met anti-PD medicijnen - checkpointremmers als pembrolizumab en nivolumab
- Radiotherapeutisch stimulerend middel NBTXR3 geeft in combinatie met anti-PD-1 medicijnen alsnog uitstekende resultaten bij patiënten die ziekteprogressie lieten zien ongeacht eerdere behandeling met anti-PD-1 medicijnen
- Rozlytrek (entrectinib), een tyrosine kinase remmer, goedgekeurd door FDA als medicijn voor solide tumoren met NTRK (neurotrophic tyrosine receptor kinase) gene fusion. Dit is 3e goedgekeurde medicijn op basis van mutatie.
- Tweede primaire vorm van kanker bij een kankerpatient wordt steeds vaker bekend bij de diagnose (2 tot 17 procent) door betere diagnose technieken en verfijnder biomoleculair onderzoek
- Tumorindeling mede aan de hand van biomarkers - biomoleculaire profielen is nodig en zal behandelingen sterk veranderen voor veel kankerpatiënten. Van 10 procent nu tot 50 procent straks. Aldus grote studie van het TOGA
- Vaccin tegen KRAS positief gemuteerde vormen van kanker - darmkankers en longkanker o.a. - wordt gecombineerd met trametinib een anti-PD medicijn in fase I studie na hoopvolle resultaten.
- Voorbeeldrapporten van receptoren en DNA testen - biomoleculaire profielen uitgevoerd door Caris Lifesciences - van alvleesklierkanker, hersentumoren, melanomen en longkanker
- Vroege diagnose van kanker is de toekomst en is vaak al mogelijk: zie TED talk
- Ziekte van Parkinson: prasinezumab, een monoklonaal antilichaam dat alfa-synucleïne bindt, vertraagt sterk de progressie van de ziekte van Parkinson in vergelijking met patienten die beste zorg kregen
- Algemeen: overzicht van artikelen waarin personal medicine een rol speelt.
Plaats een reactie ...
Reageer op "Tumorindeling mede aan de hand van biomarkers - biomoleculaire profielen is nodig en zal behandelingen sterk veranderen voor veel kankerpatiënten. Van 10 procent nu tot 50 procent straks. Aldus grote studie van het TOGA"