8 september 2023: Bron: Anthoni van Leeuwenhoek ziekenhuis, CELL Volume 186, Issue 18, 31 August 2023, Pages 3968-3982.e15 Met dank aan Joge die me dit stuurde.
Onder het kopje "voorstadium van borstkanker kan worden ontdekt met nieuwe techniek" maakte het Anthoni van Leeuwenhoek Ziekenhuis (AvL) in een nieuwsbrief en persbericht melding van een nieuwe techniek Arc-Well waarmee via oud opgeslagen tumorweefsel in een vroeg stadium van borstkanker al afwijkende gen mutaties kunnen worden ontdekt. Mutaties die voorspellen of beginnende borstkanker - Ductaal carcinoom in situ = DICS zich progressief zal ontwikkelen als borstkanker of Ductaal carcinoom in situ - DICS zal blijven en in feite geen borstkanker is.
Interessant is dat er ook cellijnen van longkanker en prostaatkanker zijn onderzocht met deze methode Arc-Well. Maar het lijkt mij ook dat bij elke nieuwe diagnose of optreden van een recidief na eeerstelijns behandeling van welke vorm van kanker dan ook een genetisch mutatie onderzoek moet worden gedaan. Naar mijn mening is het bijna crimineel dat dit nog altijd wordt geweigerd bij 90 procent van de patiënten met kanker met solide tumoren.
Het artikel van het AvL is gebaseerd op een studie met 10 patiënten op basis van het toepassen van Arc-Well op oud tumorweefsel:
Samenvatting van het abstract in het Nederlands vertaald via google translate:
Ductaal carcinoom in situ (DCIS) is een veel voorkomende voorloper van invasieve borstkanker. Ons begrip van de genomische progressie ervan naar recidiverende ziekten blijft slecht, deels als gevolg van uitdagingen die verband houden met de genomische profilering van in formaline gefixeerde, in paraffine ingebedde (FFPE) materialen.
Hier hebben we Arc-well ontwikkeld, een single-cell DNA-sequencingmethode met hoge doorvoer die vergelijkbaar is met FFPE-materialen.
We hebben onze methode gevalideerd door 40.330 afzonderlijke cellen uit cellijnen, bevroren weefsel en 27 FFPE-monsters van borsttumoren, longtumoren en prostaattumoren te profileren die gedurende 3 tot 31 jaar zijn bewaard.
Analyse van 10 patiënten met gematchte DCIS en kankers die 2 tot 16 jaar later terugkeerden, laat zien dat veel primaire DCIS al een verdubbeling van het hele genoom en klonale diversificatie hadden ondergaan en dat ze genomische lijnen deelden met persistente subklonen in de recidieven. Evolutionaire analyse suggereert dat de meeste DCIS-gevallen in onze studiegroep een evolutionair verandering ondergingen en chromosoomafwijkingen in de persistente subklonen verder identificeerden die geassocieerd waren met een recidief van kanker.
Zie dit schema gekopieeerd uit abstract van de studie:
Graphical abstract
Hier een artikel op de website van het Anthoni van Leeuwenhoek ziekenhuis waarin de studie wrodt beschreven. Daaronder het abstract van de studie uit Cell.
Voorstadium van borstkanker kan worden onderzocht met nieuwe techniek
16 aug 2023 13:00
De aanwezigheid van abnormale cellen in het melkkanaal in de borst kan duiden op een voorstadium van invasieve borstkanker. We weten alleen niet precies wanneer en hoe deze abnormale cellen zich ontwikkelen tot borstkanker. Omdat dit proces jaren – of zelfs decennia – kan duren, is het lastig om hier genetisch onderzoek naar te doen. Onderzoekers van het Nederlands Kanker Instituut, het onderzoeksinstituut van het Antoni van Leeuwenhoek, hebben nu samen met wetenschappers van het MD Anderson Cancer Center in Houston, Texas, een nieuwe methode ontwikkeld waarmee weefsel van wel 31 jaar oud nog kan worden onderzocht en waarmee gedetailleerde informatie over de biologie en de ontwikkeling tot invasieve borstkanker kan worden gevonden.
Ductaal carcinoma in situ (DCIS), zoals we deze abnormale cellen in een melkkanaal in de borst ook wel noemen, heeft zich nog niet door de wanden van deze kanalen verspreid naar het omliggende borstweefsel en is daarom nog geen borstkanker. We weten nog niet hoe we moeten voorspellen welke mensen met DCIS in de toekomst invasieve borstkanker ontwikkelen en bij wie dat niet het geval is. Dit komt onder andere vanwege de technische uitdagingen bij het onderzoeken van cellen in aangetast weefsel.>>>>>>>lees verder
Het studierapport is tegen betaling te downloaden. Hier het originele abstract:
Archival single-cell genomics reveals persistent subclones during DCIS progression
Graphical abstract
Key resources table
| REAGENT or RESOURCE | SOURCE | IDENTIFIER |
|---|---|---|
| Biological samples | ||
| Human breast tissue samples | Netherlands Cancer Institute, Duke University Hospital and Baylor College of Medicine | N/A |
| Human lung cancer samples | MD Anderson Cancer Center | N/A |
| Human prostate cancer samples | MD Anderson Cancer Center | N/A |
| Chemicals, peptides, and recombinant proteins | ||
| Formalin solution, neutral buffered, 10% | Millipore Sigma | HT5012-1CS |
| DMEM | Millipore Sigma | D5796 |
| FBS | Millipore Sigma | F0926 |
| Penicillin-streptomycin | Corning | 30-002-Cl |
| L-glutamine Solution | ||
Acknowledgments
This work was supported by grants to N.E.N. from the NIH National Cancer Institute (RO1CA240526, RO1CA236864), the CPRIT Single Cell Genomics Center (RP180684), the PRECISION Cancer Grand Challenge Grant, and the MD Anderson Moon Shot program. This study was supported by grants to E.S.H. (R01 CA185138-01, U2C CA-17-035 Pre-Cancer Atlas (PCA) Research Centers, and DOD BC132057). N.E.N. is an AAAS Fellow, AAAS Wachtel Scholar, Damon-Runyon Rachleff Innovator, and Jack & Beverly Randall Innovator.
References (61)
- et al.
A review of the management of ductal carcinoma in situ following breast conserving surgery
Breast
(2013) - et al.
Copy number analysis of ductal carcinoma in situ with and without recurrence
Mod. Pathol.
(2015) - et al.
Multiclonal invasion in breast tumors identified by topographic single cell sequencing
Cell
(2018) - et al.
Progression from ductal carcinoma in situ to invasive breast cancer: revisited
Mol. Oncol.
(2013) - et al.
Degenerate oligonucleotide-primed PCR: general amplification of target DNA by a single degenerate primer
Genomics
(1992) - et al.
Clonal decomposition and DNA replication states defined by scaled single-cell genome sequencing
Cell
(2019) - et al.
High-throughput single-cell sequencing with linear amplification
Mol. Cell
(2019) -
Reactions of nucleic acids and NucleoDroteins with formaldehyde
- et al.
Formaldehyde crosslinking: a tool for the study of chromatin complexes
J. Biol. Chem.
(2015) - et al.
Advances and applications of single-cell sequencing technologies
Mol. Cell
(2015) - et al.
Single-cell, genome-wide sequencing identifies clonal somatic copy-number variation in the human brain
Cell Rep.
(2015) - et al.
Genome-wide single-cell analysis of recombination activity and de novo mutation rates in human sperm
Cell
(2012) - et al.
Effect of three decades of screening mammography on breast-cancer incidence
N. Engl. J. Med.
(2012) - et al.
Whole-exome sequencing analysis of the progression from non–low-grade ductal carcinoma in situ to invasive ductal carcinoma
Clin. Cancer Res.
(2020) - et al.
Genomic differences between pure ductal carcinoma in situ and synchronous ductal carcinoma in situ with invasive breast cancer
Oncotarget
(2015) - et al.
Genomic and mutational profiling of ductal carcinomas in situ and matched adjacent invasive breast cancers reveals intra-tumour genetic heterogeneity and clonal selection
J. Pathol.
(2012) - et al.
Contrasting DCIS and invasive breast cancer by subtype suggests basal-like DCIS as distinct lesions
npj Breast Cancer
(2020) - et al.
Genomic landscape of ductal carcinoma in situ and association with progression
Breast Cancer Res. Treat.
(2019) - et al.
Intratumor heterogeneity: seeing the wood for the trees
Sci. Transl. Med.
(2012) - et al.
Genetic heterogeneity and cancer drug resistance
Lancet Oncol.
(2012) - et al.
Genome evolution in ductal carcinoma in situ: invasion of the clones
J. Pathol.
(2017) - et al.
Genomic alterations during the in situ to invasive ductal breast carcinoma transition shaped by the immune system
Mol. Cancer Res.
(2021) - et al.
Evolutionary trajectories and genomic divergence in localized breast cancers after ipsilateral breast tumor recurrence
Cancers (Basel)
(2021) - et al.
Chromosomal alterations in ductal carcinomas in situ and their in situ recurrences
J. Natl. Cancer Inst.
(2000) - et al.
Genomic analysis defines clonal relationships of ductal carcinoma in situ and recurrent invasive breast cancer
Nat. Genet.
(2022) - et al.
Tumour evolution inferred by single-cell sequencing
Nature
(2011) - et al.
Comprehensive human genome amplification using multiple displacement amplification
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
(2002) - et al.
Genome-wide detection of single-nucleotide and copy-number variations of a single human cell
Science
(2012) - et al.
DNA amplification method, Chinese patent CN201410448896.XA
(2016) - et al.
Single-cell whole-genome analyses by linear amplification via transposon insertion (LIANTI)
Science
(2017)
There are more references available in the full text version of this article.
Cited by (0)
Recommended articles (6)
-
Research article
A membrane-associated MHC-I inhibitory axis for cancer immune evasion
Cell, Volume 186, Issue 18, 2023, pp. 3903-3920.e21 -
Research article
NSUN2 is a glucose sensor suppressing cGAS/STING to maintain tumorigenesis and immunotherapy resistance
Cell Metabolism, 2023 -
Research article
Humanized mouse liver reveals endothelial control of essential hepatic metabolic functions
Cell, Volume 186, Issue 18, 2023, pp. 3793-3809.e26 -
Research article
A neural circuit for male sexual behavior and reward
Cell, Volume 186, Issue 18, 2023, pp. 3862-3881.e28 -
Research article
Cooperative assembly confers regulatory specificity and long-term genetic circuit stability
Cell, Volume 186, Issue 18, 2023, pp. 3810-3825.e18 -
Research article
Integrative multi-omic cancer profiling reveals DNA methylation patterns associated with therapeutic vulnerability and cell-of-origin
Cancer Cell, 2023
© 2023 Elsevier Inc.
Gerelateerde artikelen
- Arc-Well is nieuwe manier om via oud tumorweefsel een diagnose van borstkanker type DICS te maken en afwijkende genmutaties te ontdekken
- AI = Kunstmatige intelligentie is beter in het screenen op borstkanker dan dan twee radiologen die de beelden bekijken, blijkt uit een grootschalig Zweeds onderzoek.
- Alcohol vergroot kans op kanker bij vrouwen, vooral op borstkanker maar ook mond- en keelkanker en slokdarmkanker en leverkanker blijkt uit groot bevolkingsonderzoek in Engeland onder meer dan 1 miljoen vrouwen.
- Anorexia: Vrouwen met anorexia hebben minder risico op het krijgen van borstkanker in vergelijking met vrouwen zonder anorexia blijkt uit meta analyse van bevolkingsonderzoeken.
- Aspirine en NSAIDs lijken te kunnen voorkomen dat mensen met groot risico op borstkanker door erfelijke genetische afwijkingen (BRCA 1 en BRCA 2) ook werkelijk borstkanker krijgen.
- Bisphosfonaten lijken preventief te werken in het voorkomen van borstkanker voor vrouwen na de overgang. Aldus drie retropostpectieve studies. Artikel geplaatst 27 juli 2010
- Black Cohosh = zilverkruid vermindert kans op borstkanker met 61% blijkt uit een epidemologische studie gepubliceerd in International Journal of Oncology.
- Borstkanker is soms erfelijk belast. Hier enkele artikelen over BRCA 1 en 2 mutaties.
- Chemo en bestraling voor kinderen met kanker vergroot 6 tot 13 keer het risico op krijgen van borstkanker voor hun 40e jaar in vergelijking met bevolkingsrisico. copy 1
- Cosmetische borstimplantaten verhogen het risico op overlijden aan borstkanker met 28 tot 38 procent
- Foliumzuur - vitamine B speelt cruciale rol bij optredende mutaties in genen die gerelateerd zijn aan risico op kanker en specifiek bij borstkanker. copy 1
- fysieke activiteit kan voor 49 procent borstkanker voorkomen. Daarentegen veroorzaakt overgewicht en weinig bewegen en sporten vaker borstkanker
- Gezonde leefstijl met matig alcohol, 5 keer per week sporten en aandacht niet te dik te worden heeft positief effect op het risico borstkanker te krijgen bij vrouwen na de overgang
- Gebruik van antidepressiva, SSRIs, vergroot significant kans op borstkanker en eierstokkanker blijkt uit grote meta analyse.
- Groenten en fruit kunnen het risico op het krijgen van borstkanker significant verminderen. Vooral de vormen van borstkanker met oestrogeen en progesteron markers die negatief zijn is te voorkomen met een vegetarisch dieet
- hormoontherapie tegen overgangsklachten geeft een hoger risico op kanker dan werd gedacht. Blijkt uit grote meta-analyse van 58 epidemologische studies copy 1
- Hormonen: Stoppen met hormoontherapie in en na de overgang voorkomt kanker, vooral borstkanker (11%) en eierstokkanker (20%) . Blijkt uit grote wereldwijde studies.
- Humaan choriongonadotrofine (hCG), een zwangerschapshormoon, heeft een opmerkelijk effect op het genexpressieprofiel van borstweefsel van BRCA1 / 2 dragers die geen anticonceptie gebruikten.
- Koemelk dagelijks geeft hoger risico op borstkanker. Sojamelk daarentegen niet. Ook yoghurt en kaas geven geen hoger risico. Blijkt uit langjarig Amerikaans onderzoek onder ruim 50.000 vrouwen
- Leefstijl: Borstkanker komt in de Verenigde Staten bijna twee keer zoveel voor als in Zuid-Amerika en wordt vooral veroorzaakt door verschil in leefstijl.
- Lichamelijk actief zijn kan borstkanker voorkomen met wel 20 tot 40 procent. Echter dit geldt alleen voor hormoongevoelige vormen van borstkanker.
- Mammografie met aanvullende echografie bij vrouwen met dichte borsten geeft betere resultaten in vergelijking met mammografie met kuntmatige Intelligentie (AI) en in vergelijking met mammografie met echografie + AI
- Mammografie verlaagt de kans op overlijden aan borstkanker en vermindert het aantal gevorderde borstkanker op 10-jaars meting in vergelijking met vrouwen die geen mammografie hadden gehad.
- Mediterraan dieet vermindert risico op krijgen van borstkanker aanzienlijk blijkt uit meta-analyse van 18 studies.
- Mediterraan dieet plus olijfolie voorkomt significant borstkanker en ook minder agressieve vorm van borstkanker, blijkt uit subanalyse van grote langjarige studie naar risico op hart- en vaatziektes bij vrouwen uit hoge risicogroep
- Mediteraandieet met veel groenten en fruit kan borstkanker en vooral niet hormoongevoelige borstkanker (tot 40 procent) voorkomen bij vrouwen na de overgang
- MRI-scan naast het standaard bevolkingsonderzoek voor borstkanker is gevoeliger en kan vrouwen met dicht borstweefsel helpen tumoren te ontdekken maar geeft vaker vals alarm
- Persoonlijkheidsfactoren als angst, depressie, optimisme enz. heeft geen relatie met het wel of niet krijgen van borstkanker, blijkt uit Nederlandse studie.
- Ploegendienst met ook nachtdiensten verdubbelt de kans op het krijgen van borstkanker
- Raloxifene werkt net zo goed als Tamoxifen bij preventie van borstkanker bij risico vrouwen met significant minder bijwerkingen.
- Roken geeft 30% meer kans op borstkanker. Nu stoppen lijkt nog steeds zinvol, ook als preventie..
- Rood vlees vervangen door kip kan het risico op borstkanker verminderen, rood vlees verhoogt namelijk het risico, kip verkleint het risico op borstkanker
- Slapen 's nachts met licht aan geeft verhoogd risico op het krijgen van borstkanker. Hoe meer licht 's nachts hoe groter het risico.
- Screening van borstkanker via een mammografie geeft geen enkel positief effect op uiteindelijke overlevingscijfers blijkt uit 25 jarige studie bij totaal 89.835 vrouwen in de leeftijd van 40 tot 59 jaar in Canada.
- Soja eten of drinken als kind of adolescent vermindert risico op borstkanker op latere leeftijd.
- Transgender vrouwen hebben grotere kans op borstkanker door de hormonen die zij gebruikten, blijkt uit Nederlandse studie
- Vetarm voedingspatroon in combinatie met een verhoogde inname van groenten, fruit en granen kan het risico op overlijden als gevolg van borstkanker bij postmenopauzale vrouwen verminderen blijkt uit groot en lang onderzoek
- Vezelrijk dieet werkt sterk preventief (50%) tegen risico op borstkanker bij jonge vrouwen (in leeftijd voor de overgang).
- Visolie, ook ingenomen via capsules, werkt preventief in het voorkomen van borstkanker bij vrouwen in de leeftijd na de overgang. Blijkt uit een 8 jarige bevolkingstudie onder 35.000 vrouwen. Artikel geplaatst 14 juli 2010
- Hoge vitamine D (25-hydroxyvitamin D) waarden in bloed geven significant minder risico - 44 procent - op overlijden aan borstkanker dan bij lage vitamine D. waarden op moment van diagnose copy 1
- Vrouwen die dragers zijn van het BRCA1 en/of BRCA2 gen verminderen het risico op het krijgen van borstkanker met 50% en eierstokkanker met 80% door hun eierstokken en eileiders weg te laten halen.
- Voedingsadviezen ter preventie van borstkanker en vrouwelijke hormoonbalans via voeding en meditatie opgesteld door de natuurdietisten
- Voedsel rijk aan isoflavonen gecombineerd met misosoep zou kans op borstkanker met 40% verminderen aldus tienjarige Japanse studie onder ca. 22.000 vrouwen. Artikel geplaatst juni 2003.
- Wie als kind voor de pubertijd veel patat eet gebakken in slechte vetten loopt groter risico op krijgen van borstkanker op latere leeftijd blijkt uit deelstudie bij Canadese verpleegkundigen
- Wie als vrouw in haar jong volwassentijd zorgt voor een normaal gewicht heeft beduidend minder risico - 65% - op borstkanker met het BRCA 1 en 2 gen
- Preventie: overzicht van informatie hoe het risico op borstkanker kan worden verminderd
Plaats een reactie ...
Reageer op "Arc-Well is nieuwe manier om via oud tumorweefsel een diagnose van borstkanker type DICS te maken en afwijkende genmutaties te ontdekken"